Pan Virulence and resisTance Analysis 2: PanViTa 2
Software
O presente programa de computador se refere a uma ferramenta de bioinformática desenvolvida em Python para automatizar a análise comparativa de genes de resistência a antibióticos e fatores de virulência em genomas bacterianos. O sistema gerencia todo o fluxo de trabalho analítico, realizando automaticamente a configuração de dependências, o download e a indexação de bancos de dados biológicos, a obtenção e anotação de sequências genômicas, o alinhamento de proteínas e a identificação de genes de interesse mediante critérios configuráveis de identidade e cobertura. A plataforma integra bases de dados especializadas, como CARD, VFDB, BacMet e MEGARes, além de suportar a importação de arquivos GenBank e FASTA obtidos localmente ou do NCBI. Como resultado, gera matrizes de presença de genes, análises de pan-resistoma e pan-viruloma, bem como visualizações gráficas automatizadas, incluindo heatmaps, clustermaps e gráficos estatísticos. Sua arquitetura modular e extensível permite a incorporação de novos bancos de dados, funções e pipelines, proporcionando uma solução flexível, reprodutível e de alto desempenho para pesquisas em genômica bacteriana.
• Automação completa do fluxo de análise: integra em uma única ferramenta a configuração do ambiente, obtenção de dados, anotação genômica, alinhamento, identificação de genes e geração de resultados.
• Arquitetura flexível e extensível: permite incorporar novos bancos de dados, arquivos genômicos, funções e pipelines, adaptando-se a diferentes aplicações em bioinformática.
• Análises rápidas, reprodutíveis e de fácil interpretação: gera automaticamente matrizes analíticas e visualizações gráficas de alta qualidade, facilitando a interpretação dos padrões de virulência e resistência em múltiplos genomas bacterianos.
Inventores
Victor Silveira Caricatte, Diego Lucas Neres Rodrigues, Flávia Figueira Aburjaile
Estágio de desenvolvimento
Desenvolvimento concluído.
Tipo de proteção
Propriedade Intelectual
Número de Registro: PC202500261
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