GIPSy2 é um programa desenvolvido para realizar a predição de ilhas genômicas em larga escala e considerando um número significante de genomas. Seu propósito é aumentar a escalabilidade das análises de plasticidade genômica. Seu ponto
de inovação se dá pelo uso de módulos de análise múltipla escritos em python3, além do uso de modelos estatísticos de regressão e redução dimensional capazes de gerar valores de confiança para cada resultado gerado.