A presente tecnologia trata de dois iniciadores, definidos pelas SEQ ID N° 1 e 2, um kit contendo os iniciadores e um método para detecção molecular de Aspergillus welwitschiae, agente etiológico da podridão vermelha da espécie vegetal Agave sisalana e seus híbridos, conhecidos como sisal, baseado na técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). A tecnologia se refere ainda ao uso dos iniciadores e do kit para o diagnóstico da podridão vermelha do sisal.